Upravit stránku

Využití produktu LIGHTrun je velmi rychlé, pohodlné a uživatelsky velmi přívětivé. Probíhá tak, že zákazník si zakoupí samolepící barcody, kterými označí své vzorky (zkumavky nebo platíčka) a takto označené vzorky odešle ke zpracování do laboratoře. Barcody obsahují čárový kód, který v systému GATC Biotech identifikuje vzorek v průběhu zpracování a dodání výsledku zákazníkovi.

Návod využití produktu LIGHTrun

  1. Zákazník se zaregistruje pod svým emailem, přes který bude nadále s GATC Biotech komunikovat (potvrzení o doručení vzorků do laboratoře, dodání výsledků sekvencí apod.) Tím si vytvoří svůj myGATC účet.
  2. Následně ve svém myGATC aktivuje zakoupené barcody (BATCH a BIN barcodů na dodaných barcodech.)
  3. Zákazník připraví své vzorky dle technické specifikace níže. Prosíme neuzavírejte zkumavky pomocí parafilmu.
  4. Zákazník nalepí větší číst barcodu na zkumavku se vzorkem a menší číst si ponechá pro svou evidenci použitých čísel barcodů.
  5. Zákazník odešle vzorky kurýrní službou. Lze zvolit kurýrní službu dle vlastního výběru nebo využít předplacenou službu UPS. V tom případě dostává zákazník na každých 25 zakoupených vzorků jednu samolepku UPS pro odeslání zdarma a objedná si individuální pick-up kurýrem na nejbližší pobočce UPS. Velmi oblíbené je využití sběrných boxů zdarma, jejichž seznam a umístění najdete v záložce Kontakty.
  6. Po doručení vzorků do laboratoře obdrží zákazník informační email.
  7. Po zpracování vzorků zákazník už jen klikne na Download results a stáhne si výsledky do svého počítače.

Technické požadavky na vzorky:

  • předčištěná plasmidová DNA nebo předčištěné PCR fragmenty smíchané s primerem v jedné zkumavce
  • 5 ul templátu DNA v koncentraci buď přečištěná plastidová DNA 80-100 ng/ul nebo přečištěný PCR produkt 20-80 ng/ul
  • přidat 5ul primeru v koncentraci 5uM (5 pmol/ul)
  • prosím zašlete vzorek v celkovém objemu 10ul v 1,5 ml zkumavce
  • vzorky je možné nechat za poplatek předčistit v laboratoři GATC Biotech

Charakteristika primeru:

  • tavící teplota primeru mezi 52-58 stupni Celsia
  • délka ideálně  17-19bp
  • GC obsah 17mer 7-9 G+C
  • u 18mer 8-9 G+C
  • u 19mer 7-9 G+C
  • G nebo C my měly být na 3´ konci, ale ne více než 3Gs nebo Cs
  • sekvence primeru by měla být mix všech čtyř nukleotidů s ne více než 4 stejnými bázemi v řadě (AAAA nebo GGGG)

Využívaná technologie:

  • ABI 3730xl DNA Analyzer systems (96 capillary instrument)
  • Data jsou uchovávána v databázi GATC Biotech po dobu 12 měsíců. Vzorky a primery jsou uchovávány 10 dní od doručení do laboratoře.

Formát dodávaných dat:

  • chromatogram (.ab1, ABI file)
  • text file (.seq, SEQ file) 
  • fasta format (.fas, FAS file)
Nahoru