Upravit stránku

Využití produktu SUPREMErun je velmi rychlé, pohodlné a uživatelsky velmi přívětivé. Probíhá tak, že zákazník si zakoupí samolepící barcody, kterými označí své vzorky (zkumavky nebo platíčka) a takto označené vzorky odešle ke zpracování do laboratoře. Barcody obsahují čárový kód, který v systému GATC Biotech identifikuje vzorek v průběhu zpracování a dodání výsledku zákazníkovi. U služby SUPREMErun zákazník dodává zvlášť DNA a zvlášť primer.

Zajímavou variantou je vybrat si ZDARMA některý z cca 120 standardních primerů v nabídce GATC Biotech a nechat si jej namíchat se vzorkem. Zákazník tak ušetří jak práci tak peníze za nákup vlastní chemie.

Zákazník si rovněž může nechat za jednorázový poplatek nasyntetizovat svůj specifický primer, který zůstane v databázi GATC Biotech a je následně bez omezení zdarma používám pro zpracování vzorků zákazníka (podmínkou je využití tohoto primeru alespoň jednou za šest měsíců pro uchování v databázi)

Velkou výhodou produktu SUPREMErun je možnost resekvenace zdarma a konzultace s pracovníky technické podpory GATC Biotech.

Návod využití produktu SUPREMErun

  1. Zákazník se  zaregistruje pod svým emailem, přes který bude nadále s GATC Biotech komunikovat (potvrzení o doručení vzorků do laboratoře, dodání výsledků sekvencí apod.) Tím si vytvoří svůj myGATC účet.
  2. Následně ve svém myGATC aktivuje zakoupené barcody (BATCH a BIN barcodů na dodaných barcodech.)
  3. Zákazník připraví své vzorky dle technické specifikace níže. Prosíme neuzavírejte zkumavky pomocí parafilmu.
  4. Zákazník nalepí větší číst barcodu na zkumavku se vzorkem a menší číst si ponechá pro svou evidenci použitých čísel barcodů.
  5. UPOZORNĚNÍ. U produktu SUPREMErun zasílá zákazník zvlášť DNA a zvlášť primer, obojí je smícháno v laboratoři. Na zkumavku se vzorkem se lepí zelený barcod, na zkumavku s primerem žlutý barcod.
  6. Současně zákazník ve svém účtu na myGATC vyplní jednoduchou tabulku on-line objednávky, kde vyplní, který vzorek DNA si přeje namíchat se kterým primerem. Lze například použít jeden primer k několika zkumavkám s DNA apod.
  7. Zákazník odešle vzorky kurýrní službou. Lze zvolit kurýrní službu dle vlastního výběru nebo využít předplacenou službu UPS. V tom případě dostává zákazník na každých 25 zakoupených vzorků jednu samolepku UPS pro odeslání zdarma a objedná si individuální pick-up kurýrem na nejbližší pobočce UPS. Velmi oblíbené je využití sběrných boxů zdarma, jejichž seznam a umístění najdete v záložce Kontakty.
  8. Po doručení vzorků do laboratoře obdrží zákazník informační email.
  9. Po zpracování vzorků zákazník už jen klikne na Download results a stáhne si výsledky do svého počítače.

Velkou výhodou produktu SUPREMErun je možnost resekvenace zdarma a konzultace s pracovníky technické podpory GATC Biotech.

Technické požadavky na vzorky:

  • plasmidová DNA 30-100ng/ul, 20 ul v 1,5ml zkumavkách nebo nebo PCR fragmenty 10-50ng/ul, 20 ul v 1,5ml zkumavkách, cosmidy/BAC/PAC min. 100ng/ul
  • 20ul vzorku a 20ul primeru postačuje na 8 reakcí
  • vzorek je ideálně dodán rozpuštěn ve vodě, bez obsahu EDTA
  • vzorky je možné nechat za poplatek předčistit v laboratoři GATC Biotech

Charakteristika primeru:

  • 10pmol/ul, 20ul v 1,5 ml zkumavce
  • tavící teplota primeru mezi 52-58 stupni Celsia
  • délka ideálně  17-19bp
  • GC obsah 17mer 7-9 G+C
  • u 18mer 8-9 G+C
  • u 19mer 7-9 G+C
  • G nebo C my měly být na 3´ konci, ale ne více než 3Gs nebo Cs
  • sekvence primeru by měla být mix všech čtyř nukleotidů s ne více než 4 stejnými bázemi v řadě (AAAA nebo GGGG)

Využívaná technologie: 

  • ABI 3730xl DNA Analyzer systems (96 capillary instrument)

  • Data jsou uchovávána v databázi GATC Biotech po dobu 12 měsíců. Vzorky a primery jsou uchovávány 10 dní od doručení do laboratoře.

Formát dodávaných dat:

  • chromatogram (.ab1, ABI file)
  • text file (.seq, SEQ file) 
  • fasta format (.fas, FAS file)
Nahoru