Upravit stránku

Na poli genetické sekvenace se zabýváme zejména poskytováním servisu v oblasti zpracování dat, a to jak Sangerovou metodou, tak i metodami genetické sekvenace 2. a 3. generece - viz. Sekvenace nové generace. Důvodem, proč zvolit zajištění genetické sekvenace formou externího nákupu této služby je nemalá úspora finančních prostředků stejně jako úspora času a práce vlastních zaměstnanců.

Vyplatí se nákup sekvenačního přístroje?

Zakoupení vlastního sekvenačního přístroje je jistě zajímavá investice, nicméně jeho majitel je nucen řešit dva zásadní problémy. Tím prvním je velmi rychlé morální zastarávání přístrojů, kdy mnohdy během jednoho jediného roku mají nové přístroje upgrade nezbytný pro jeho správné fungování.

Druhým problémem jsou nemalé náklady na provoz vlastního přístroje, ať už se jedná o nákup potřebných reagencií a dalšího materiálu, nebo náklady spojené s provozem a údržbou přístroje. V neposlední řadě je nutné disponovat kvalitním bioinformatikem, který bude schopen v reálném čase zpracovat výstupní data sekvenátoru do potřebného formátu.

Výhody sekvenace jako externí služby:

  • Sekvenace je zpracována v renomovaných certifikovaných laboratořích v zahraničí.
  • Celkový čas zpracování vzorků zákazníka se pohybuje u NGS zhruba do 6 týdnů, u sekvenace Sangerovou metodou 1-3 dny, zatímco zpracování na vlastním přístroji obvykle trvá výrazně déle (až 2-3 měsíce).
  • Výstup je zpracován odbornými bioinformatiky ve formě, která je přímo použitelná pro další zpracování, publikaci apod.
  • Příznivá cena této služby - například sekvenace Sangerovou metodou stojí u naší společnosti pouze 3,20€ za 1 reakci, v případě zpracování více vzorků v 96jamkové destičce pak vyjde na 2,60€ viz. ceník.

Pro nové zákazníky nabízíme OTESTOVÁNÍ ZDARMA formou dodání 3 kusů barcodů tubes!!!​​​​​​​

Sangerovo sekvenování od GATC Biotech

GATC Biotech zpracuje širokou škálu výchozích materiálů dodaných ve zkumavkách či destičkách. Výsledky sekvenování mají vysokou kvalitu a jsou k dispozici on-line během několika hodin přes myGATC účet. Společnost nabízí 2 typy produktů:

LIGHTrun a SUPREMErun

Produkt LIGHTrun

Tato služba zahrnuje sekvenování předem smíchaných vzorků DNA s primery. Nabízí sekvenační čtení až 1100 nt v Phred20 kvalitě a je k dispozici s volitelnou službou NightXpress pro maximální rychlost doručení výsledků.

Formáty:

  • LIGHTRUN 96 | BARCODE: 96jamkové destičky s čárovými kódy
  • LIGHTRUN TUBE | BARCODE: zkumavky s čárovými kódy
  • LIGHTRUN TUBE NIGHTXPRESS | BARCODE: zkumavky s čárovými kódy/ výsledky mezi 8-13 hod v následující pracovní den

Produkt SUPREMErun

Poskytuje sekvenování komplikovaných templátů. Nabízí optimalizované protokoly pro GC bohaté sekvence a vlásenkové a sekundární struktury, které často brzdí sekvenační reakci. Na vyžádání získáte zdarma SNP a INDEL analýzu.

Formáty:

  • SUPREMERUN 48 | READY-TO-LOAD: až 48 vzorků připravených kitem ABI BigDye Terminator cycle sequencing v 3.1
  • SUPREMERUN 96 | READY-TO-LOAD: 96jamkové destičky/vzorky připravené kitem ABI BigDye Terminator cycle sequencing v 3.1
  • SUPREMERUN 48 | BAC/FOSMID/COSMID: až 48 velkých klonovacích vektorů
  • SUPREMERUN 96 | BAC/FOSMID/COSMID: 96jamkové destičky /velké DNA konstrukty
  • SUPREMERUN 48: dlouhá vysoce kvalitní čtení/ až 48 vzorků
  • SUPREMERUN 96 | BARCODE: 96jamkové destičky s čárovými kódy
  • SUPREMERUN 96: 96jamkové destičky
  • SUPREMERUN 96 | MULTIPRIMER: 96jamkové destičky /flexibilní/ mnoho plasmidů nebo PCR produktů s různými primery
  • SUPREMERUN TUBE | BARCODE: plasmidy nebo PCR produkty v 1,5ml zkumavkách s čárovými kódy/ komplikované templáty
  • SUPREMERUN TUBE: plasmidy nebo PCR produkty v 1,5ml zkumavkách

Potřebujete více informací o Sangerové metodě? Kontaktujte nás!

  • Položky označené hvězdičkou (* ) jsou povinné.
Nahoru